Фамилия Дохан — редкая и неоднозначная по происхождению. Скорее всего, она не русская по корню, а пришла из тюркских или кавказских языков, либо является искусственной (семинарской) фамилией в духовной среде.

Самый прямой путь к значению — разбор корня «дохан». В тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) слово «дохан» или «духан» означает «торговец», «лавочник», а также «лавка», «магазин». В этом случае фамилия образована от прозвища или профессии предка: Дохан — человек, владевший лавкой или торговавший. По модели образования фамилия не имеет типичного русского суффикса (-ов, -ин, -ский), что указывает либо на её нерусское происхождение (например, горские евреи, караимы, крымские татары), либо на позднюю фиксацию в документах без русификации.

Вторая версия — фамилия могла возникнуть в среде православного духовенства как искусственная, от греческого слова «доха» (δόξα) — «слава», «мнение». Такие фамилии давали выпускникам семинарий, меняя или переводя бытовые прозвища на благозвучный лад. Однако в этом случае ожидалась бы форма Дохин или Дохинский, а не Дохан. Версия с греческим корнем слабее, но полностью исключать её нельзя, особенно если фамилия встречается в центральных губерниях России.

Географически фамилия Дохан встречается в основном на юге России, в Поволжье, а также среди армян и горских евреев. У армян «дохан» означает «кузнец» (от «дох» — железо), и фамилия могла указывать на ремесло. Если предки были кузнецами, это объясняет, почему фамилия не получила стандартного русского окончания — её просто записали как прозвище.

Однозначного ответа, откуда именно пошла фамилия, нет. Но наиболее вероятно — от прозвища по занятию: либо торговец, либо кузнец. Спор между этими версиями разрешается только знанием конкретной семейной истории и региона, откуда родом первые носители.