Фамилия Доконова — женская форма фамилии Доконов, и её разбор стоит начать с мужского варианта, который встречается крайне редко. В основе фамилии лежит прозвище или неканоническое имя Докон. Слово «докон» в русских говорах имело несколько значений, но самое устойчивое связано с понятием «конец», «предел», «окончание». В словаре Владимира Даля «докон» — это «конец, край, предел», а также «срок, окончание работы». Отсюда прозвище Докон мог получить человек, который завершал какое-либо дело, был замыкающим в каком-то процессе, или, напротив, тот, кто жил на краю села, на «доконе» — на самой окраине.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с тюркским корнем «докан» или «тукан» — «рождённый», «сын». В этом случае Доконов могло быть русифицированной формой фамилии, восходящей к тюркскому личному имени Докан. Однако для русской ономастики более характерно образование от славянского нарицательного слова, тем более что суффикс -ов типичен для русских фамилий, образованных от прозвищ, а не от заимствованных имён.

Фамилия Доконова, как и Доконов, географически относится к числу редких. Она встречается в основном в центральных и южных регионах России, а также среди казачества, где прозвища часто фиксировали особенности характера или быта. В дореволюционных переписях Доконовы могли быть как крестьянами, так и однодворцами — людьми, занимавшими промежуточное положение между крестьянами и мелкими помещиками. Учитывая значение слова «докон», предок носителя фамилии мог быть подрядчиком, заканчивающим работы, или просто человеком, получившим прозвище за привычку доводить дела до конца.