Фамилия Домус — редкий случай, когда корень ведёт не в славянские наречия, а в латынь или балтийские языки. Сразу две версии, и обе имеют право на существование.

Первая гипотеза отсылает к латинскому слову domus — так в Древнем Риме называли дом-особняк, резиденцию одного рода. Такой дом был автономным архитектурным целым со скатами крыши внутрь и собственными выходами на улицу. Если следовать этой версии, родоначальник фамилии мог быть состоятельным человеком, владельцем фамильного особняка, и прозвище закрепилось за ним как указание на статус и богатство. В пользу этой версии говорит и то, что слово «domus» через латынь попало во многие европейские языки как основа для «дома» (исп. domo, итал. duomo и др.).

Вторая версия связывает фамилию с литовским словом «domus» — «внимательный». В этом случае прозвище давалось по личным качествам: так могли назвать человека зоркого, вдумчивого, не упускающего деталей. Литовский след в фамилии не случаен: исторические области Литвы и Беларуси дали много фамилий с балтскими корнями.

С точки зрения словообразования, фамилия Домус — «чистая» основа без типичных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский). Это указывает на то, что она могла быть заимствована в готовом виде или образована от прозвища, которое не переоформляли по патронимической модели. Такие фамилии чаще встречаются у потомков иностранцев, выходцев из Прибалтики или у людей, получивших прозвище в среде, где латынь была языком образования и права (например, в духовных училищах или университетах).

Однозначно сказать, какая из версий вернее, сложно: обе опираются на реальные языковые факты. Но если исходить из географии бытования, балтийский след выглядит чуть более вероятным для восточноевропейской фамилии, тогда как латинская версия — скорее книжная, учёная, возможная для фамилии, возникшей в среде духовенства или образованного дворянства.