Фамилия Дубинкин образована от прозвища Дубинка, которое восходит к нарицательному «дуб». Прозвища Дубина, Дубинка были довольно распространенными в Древней Руси. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Дубинка, со временем получил фамилию Дубинкин.