Фамилия Дунюшкин — типичный пример русской фамилии, образованной от уменьшительно-ласкательной формы личного имени. В её основе лежит имя Дуня, которое в русской народной традиции было сокращением от Авдотья (каноническая форма Евдокия). Суффикс -ушк- придаёт форме особую мягкость и принадлежность к бытовой, семейной среде: Дуня → Дунюшка. Далее к основе Дунюшк- добавился фамильный суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей?» — Дунюшкин, то есть сын или потомок Дунюшки.

Такая словообразовательная модель (женское имя + -ин) встречается в русских фамилиях нередко, но обычно она указывает на то, что главу семьи называли по матери или жене. В крестьянской среде, где фамилии закреплялись в XIX веке, прозвище «Дунюшка» могло относиться к мужчине, которого в семье или деревне ласково называли по имени матери или жены. Были случаи, когда мужчину звали «Дуня» или «Дунюшка» в насмешку или по привычке, если он был особенно привязан к женщине с таким именем. Однако правдоподобнее, что фамилия Дунюшкин возникла как матроним — по матери, которая носила имя Авдотья и была известна в округе как Дунюшка. В условиях, когда отец мог умереть рано или отсутствовать, дети получали фамилию по матери.

С точки зрения географии, фамилия Дунюшкин не относится к числу широко распространённых. Её корни, скорее всего, лежат в центральных или северных губерниях России, где имя Авдотья было особенно популярно. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые доминируют в южнорусских и восточных областях, фамилии на -ин чаще встречаются в северных и центральных регионах, что косвенно подтверждает возможную локализацию Дунюшкиных.

В ономастических словарях фамилия Дунюшкин не фигурирует как отдельная статья у Б. Унбегауна или В. Никонова, но она вписывается в общую модель образования от уменьшительных форм женских имён. Сравните с однокоренными: Дунькин, Дунин, Дуняев — все они восходят к тому же корню «Дун-», но различаются суффиксами. Дунюшкин — самая «ласковая» из них, что говорит о домашнем, неофициальном происхождении прозвища.

Таким образом, фамилия Дунюшкин означает «потомок Дунюшки» (женщины по имени Авдотья). Её носитель, скорее всего, происходил из крестьянской или мещанской среды, где фамилии фиксировались по материнской линии. Никаких дворянских корней или связи с известными историческими личностями у этой фамилии нет — это простая, но живая память о предке, которого в семье называли ласково.