Фамилия Дупан — редкий случай, когда основа не поддаётся однозначному толкованию, а суффикс подсказывает больше, чем корень. Формант -ан в русских фамилиях не так распространён, как -ов или -ин, и обычно указывает на прозвищное происхождение. Чаще всего фамилии на -ан образовывались от глагольных основ или характеризовали человека по действию, внешности или повадке. Поэтому Дупан — это, скорее всего, прозвище, которое затем закрепилось как фамилия.

Самая прямая версия лежит на поверхности: в южнорусских и украинских говорах глагол «дупать» означал «топать», «ступать тяжело», «идти вразвалку». Человек с тяжёлой походкой или грузный, медлительный мог получить прозвище Дупан. Это типичная модель для фамилий-характеристик: Топан, Ступан, Шарпан — все они образованы по одному образцу от звукоподражательных или описательных глаголов. В пользу этой версии говорит и то, что фамилия встречается в западных и южных областях России, где «дупать» было в ходу.

Вторая версия — тюркская, но менее вероятная. В некоторых тюркских языках «дупан» или «дубан» могло означать «запруда», «плотина» или «насыпь». Однако фамилии от такого корня обычно оформлялись тюркскими суффиксами (-ов, -ев) и не давали чистого «Дупан» без русского окончания. Если бы предок был строителем запруд, фамилия скорее звучала бы как Дупанов. Поэтому тюркский след возможен только при условии, что фамилию записали на слух без адаптации, но это редкость.

География фамилии тоже говорит в пользу славянской версии. Дупаны встречаются в основном в Белгородской, Воронежской и Ростовской областях, а также на Украине — в зоне, где говор с его «дупать» был естественным. Носители фамилии, как правило, были крестьянами или казаками, и прозвище могло даваться за манеру ходить, а не за род занятий.

Сравнение с однокоренными фамилиями подтверждает эту картину. Есть фамилия Дупак — тоже от «дупать» (ср. «топать» → Топак), и Дупалов, где суффикс -лов указывает на действие. Все они ведут к одному корню. Дупан стоит в этом ряду как краткая, «прозвищная» форма, без дополнительных суффиксов принадлежности.

Таким образом, фамилия Дупан — это прозвище человека с тяжёлой, раскачивающейся походкой, данное в среде южнорусских или украинских говоров. Предки носителя этой фамилии, скорее всего, были простыми крестьянами, и прозвище закрепилось за их родом без изменений.