Фамилия Дуйшенова — яркий пример тюркского происхождения, который выдает в своих носителях выходцев из Средней Азии, скорее всего, из Киргизии (Кыргызстана) или Казахстана. Это женская форма фамилии Дуйшенов, а ее основа — мужское имя Дуйшен.

Имя Дуйшен — это фонетический вариант арабского имени Дуйшан, которое, в свою очередь, восходит к персидскому «душанбе» — «понедельник». В мусульманской культуре была распространена традиция называть ребенка днем недели, в который он родился. Таким образом, буквально имя Дуйшен означает «рожденный в понедельник». Такая модель имянаречения встречается у многих тюркских народов: вспомните казахское имя Жекшен (от «жексенбі» — воскресенье) или таджикское Шанбе.

Фамилия образована по стандартной для региона модели: к имени Дуйшен добавили русский патронимический суффикс -ов (в женском роде — -ова). Это произошло в XIX–XX веках, когда Российская империя, а затем и СССР вводили обязательные фамилии для кочевых и оседлых народов. Склонение фамилии подчиняется правилам русского языка: нет Дуйшеновой, дать Дуйшеновой.

Географически фамилия Дуйшенова наиболее плотно сконцентрирована в Киргизии, особенно в Ошской и Джалал-Абадской областях, а также встречается среди киргизской диаспоры в России и Казахстане. Встречается она и у узбеков, но реже.

Отдельного внимания заслуживает ударение. В самой Киргизии ударение в имени Дуйшен часто падает на первый слог: Дýйшен. Однако в русскоязычной среде фамилию чаще произносят с ударением на второй слог: Дуйшéнова. Оба варианта допустимы, но первый — более аутентичный.