Фамилия Двойнишниковы — редкий пример, где прозвище, а затем и фамилия, образованы не от профессии или внешности, а от действия или состояния. Основа здесь — глагол «двоить», который в старину имел несколько бытовых значений: мог означать «разделять надвое», «повторять», «делать двойным». От него и пошло прозвище Двойнишник — человек, который «двоит».

Самый прямой смысл прозвища — тот, кто рождается в паре, то есть близнец или двойняшка. В крестьянской среде двойняшки были редкостью и сразу получали прозвищное отличие: Первак, Вторак, Двойнишник. Но глагол «двоить» имел и переносное значение — «быть похожим как две капли воды». Поэтому Двойнишником могли назвать не только близнеца, но и человека, который до степени смешения напоминал кого-то другого — отца, брата или даже известного в округе человека.

Фамилия строится по стандартной модели: прозвище на -ник → фамилия на -ов. Суффикс -ник в прозвищах указывал на носителя признака или действия (сравните: Путник, Грешник, Двойнишник). А окончание -ов — типичный русский патронимический суффикс, означающий «сын» или «потомок»: Двойнишников — сын Двойнишника.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным губерниям России — такие прозвища на -ник реже встречались на юге, где были распространены формы на -енко. В переписных книгах XVII–XVIII веков Двойнишниковы могли записываться как крестьяне или посадские люди — сословная принадлежность невысокая, что типично для прозвищных фамилий, не связанных с дворянскими родами.

Спорных версий немного. Иногда пытаются связать фамилию с ремеслом «двойника» — человека, который делал что-то вдвойне (например, пахарь, вспахивающий поле дважды). Но это натяжка: в говорах нет устойчивого термина «двойнишник» для обозначения ремесленника. Правдоподобнее версия с близнецом или внешним сходством — она проще и подтверждается логикой народных прозвищ.

Фамилия Двойнишниковы — нечастая, но устойчивая. Она не «затерлась» до формы Двойников (которая тоже существует, но более распространена), а сохранила редкий суффикс -нишн-, который делает её узнаваемой и отличает от однокоренных. Это хороший пример того, как русская фамилия может хранить в себе не только имя предка, но и бытовую деталь — факт рождения двойни или поразительное сходство с кем-то из семьи.