Прозвище Двойня восходит к глаголу «двоить», у которого было несколько значений. Однако не исключено, что Двойнем называли человека, который был внешне очень сильно на кого-то похож. По другой версии, в основе фамилии Двойных лежит мирское имя Двойня, очевидно, получил второй ребёнок в семье. Имена, указывающие на то, каким по счёту в семье родился ребёнок, были очень популярны на Руси. К числу подобных именований относится и имя Двойня. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Двойня, со временем получил фамилию Двойных.