Фамилия Джанабаева — женская форма мужской фамилии Джанабаев, и её разумнее разбирать через мужской вариант, потому что в основе лежит тюркское имя или прозвище. Судя по структуре, фамилия образована по русской модели с суффиксом -ев (фонетический вариант -ов после мягких и шипящих), который в тюркских фамилиях часто прирастает к основе на -бай. Корень здесь — Джана-, а вторая часть — -бай, что сразу указывает на восточное происхождение.

Слово «бай» в тюркских языках означает «богатый», «господин», «хозяин», а в составе имён и прозвищ указывало на знатность, достаток или уважение. Первая часть, «Джана», скорее всего, восходит к персидскому или тюркскому «джан» — «душа», «жизнь», «любимый». В тюркских языках (особенно в казахском, татарском, азербайджанском) «джан» — распространённый компонент имён и обращений. Таким образом, Джанабай — это составное имя, которое можно перевести как «богатый душой», «любимый господин» или «душа-богач». Вариант с «джан» и «бай» встречается у многих тюркских народов, но географически фамилия Джанабаева чаще всего связана с Казахстаном и регионами Поволжья, где сильны тюркские корни.

Словообразовательная модель проста: к личному имени Джанабай (или прозвищу) добавили русский патронимический суффикс -ев, получив Джанабаев, а затем — окончание женского рода -а. В русской традиции XIX–XX веков такие фамилии закреплялись за семьями, где предок носил это имя. Сословно носители могли быть из разных слоёв: от крестьян до купцов, но «бай» в основе намекает, что предок мог быть зажиточным или уважаемым человеком в своей общине. Однако точных данных о социальном статусе всех носителей нет.

Спорных версий у этой фамилии немного. Иногда «Джана» путают с арабским именем Джана (от «джанна» — рай), но это менее вероятно, так как «джан» в тюркском контексте встречается чаще, а сочетание с «бай» — типично именно для тюркской ономастики. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) такая модель разбирается на примере других фамилий на -баев, где основа — тюркское имя. Так что Джанабаева — это типичный пример слияния тюркского имени с русским суффиксом, что отражает многовековое соседство культур.