Фамилия Джукусов — один из тех редких случаев, когда корень не славянский, и разобрать её можно только в контексте тюркских языков. Основа здесь — «джукус» (или «жукус»), что в переводе с ряда тюркских наречий означает «сороконожка» или «многоножка». Вряд ли предка так прозвали за любовь к этим насекомым: скорее, прозвище носило ироничный или описательный характер — например, так могли назвать человека с быстрыми, мелкими движениями, суетливого, или того, кто умел делать несколько дел сразу.

Суффикс «-ов» указывает на русскую модель оформления фамилии, типичную для регионов, где тюркские имена и прозвища адаптировали под русскую грамматику. Фамилия Джукусов, скорее всего, формировалась в среде, где жили ногайцы, казахи, каракалпаки или кумыки — народы, у которых слово «джукус» встречается в бытовой лексике. Встречается и вариант написания через «Ж» — Жукусов, но он менее распространён.

С точки зрения словообразования, фамилия прямая: от прозвища Джукус с помощью патронимического суффикса «-ов». Это значит, что первый носитель, скорее всего, был сыном человека по прозвищу Джукус. Сословная принадлежность таких фамилий чаще всего крестьянская или казачья — в документах XIX века подобные прозвищные фамилии встречаются у оседлых тюркских групп, перешедших к русскому делопроизводству.

Интересная деталь: у фамилии Джукусов нет варианта с суффиксом «-ин», хотя это могло бы случиться, если бы основа оканчивалась на «-а». Но форма на «-ов» закрепилась, и это типично для фамилий, образованных от тюркских основ, попавших в русскую среду через мужскую линию.