Фамилия Джунускалиева — характерный пример тюркской модели образования, где к основе прибавляется русский патронимический суффикс, но с казахским или киргизским корнем. Разбор стоит начать с мужской формы — Джунускалиев, так как женский вариант лишь указывает на пол носителя. Основа фамилии — личное имя Джунускали, которое, в свою очередь, сложное. Первая часть «Джунус» — это тюркская передача арабского имени Юнус (библейский Иона), широко распространённого в исламском мире. Вторая часть «кали» — вариант имени Кали или Гали (от али — «возвышенный», «великий»), также арабского происхождения. Таким образом, Джунускали — это двусоставное имя, где соединены два уважаемых в исламе имени: Юнус и Али. Такие сдвоенные имена нередко давали, чтобы усилить благословение или в честь двух предков.

Суффикс «-ев» (а не «-ов») указывает на то, что основа имени заканчивалась на мягкий согласный или «и». В русской канцелярской традиции XIX–XX веков при оформлении документов для тюркских народов окончание фамилии часто унифицировали по русскому образцу. Географически фамилия Джунускалиева наиболее типична для Казахстана и Киргизии, реже встречается среди каракалпаков и узбеков. Встречаются варианты написания с одной «с» — Джунукалиев, что может быть следствием упрощения при записи или диалектного произношения.

Интересная деталь: в отличие от многих фамилий на «-ов», образованных от профессий или прозвищ, эта напрямую ведёт к личному имени. Это значит, что предок носителя не был ремесленником или обладателем яркой внешности — его просто звали Джунускали, и фамилия закрепилась за его потомками как указание на родство. В среде кочевых народов такие фамилии (по имени отца или деда) появлялись позже, чем у оседлых, часто только в XIX–начале XX века при первой всеобщей переписи. Поэтому носители фамилии Джунускалиева — почти наверняка потомки человека, жившего не ранее середины XIX века, чьё имя стало родовым.