Фамилия Джунусалиев — самобытный памятник восточной культуры. Она образована от имени Джунусали, которое в свою очередь является производной формой от имени Юнусгали. Это имя составное: первая часть, Юнус, восходит к имени пророка Юнуса (библейского Ионы), а в древнееврейском языке слово «юнус» означает «голубь». Вторая часть, «гали», имеет арабские корни и переводится как «высокопоставленный, высший, могучий, великий». Соединив эти значения, имя Юнусгали можно трактовать как «голубь, превосходящий над всеми» или «великий, как голубь». Имя Джунусали — результат местного фонетического переоформления того же имени, характерного для тюркских языков Центральной Азии. Потомка человека по имени Джунусали и стали называть Джунусалиевым.

Модель образования фамилии — классическая для этого региона: к основе имени добавляется русский патронимический суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягких и шипящих). Это указывает на то, что фамилия оформилась уже в период вхождения Средней Азии в состав Российской империи или в советское время, когда фиксация фамилий по русскому образцу стала обязательной. Безусловно, фамилия Джунусалиев — замечательный памятник восточной культуры, однако процесс её формирования был длительным и не всегда имел привязку только к одной местности. Окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Джунусалиев можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований, но её корни уверенно ведут в среду мусульманского населения, говорящего на тюркских языках, — скорее всего, к киргизам или казахам.