Фамилия Дзизенко образована по распространённой украинской модели с суффиксом -енко, который исторически означал «сын» или «потомок». Таким образом, Дзизенко — буквально «сын Дзизо» или «потомок Дзизо». Вся смысловая нагрузка фамилии сосредоточена в основе, а суффикс лишь указывает на родственную связь.

Корень восходит к прозвищу Дзизо, которое этимологи связывают с украинским глаголом «дзизнути». Этот глагол имеет целый спектр звукоподражательных значений: «просвистеть», «прожужжать», «взвизгнуть» или «звякнуть». Скорее всего, прозвище отражало какую-то особенность поведения или речи предка — возможно, он имел привычку насвистывать, обладал резким голосом или его сопровождала какая-то звуковая примета.

Существует и вторая, менее вероятная версия, которая считает фамилию Дзизенко фонетическим вариантом фамилии Зизенко. В этом случае основа восходит к украинскому слову «зиз» — «косоглазие». Однако логика здесь не прямая. Вряд ли прозвище давали человеку с реальным физическим недостатком: у славян существовал суеверный обычай давать детям «обманные» внутрисемейные прозвища, чтобы отвести злые силы. Родители, желая видеть сына красивым и здоровым, могли назвать его Зизо — то есть наоборот, «кривым», чтобы сглаз «не заметил» настоящей красоты ребёнка.

Из двух версий первая — звукоподражательная, от глагола «дзизнути» — представляется более правдоподобной. Она объясняет фамилию через конкретное живое прозвище, а не через сложный суеверный перенос. В любом случае, прозвище Дзизо со временем закрепилось как наследственное имя, а суффикс -енко окончательно оформил фамилию, указав на происхождение от конкретного человека.