Фамилия Еесенкова — редкий случай, когда написание и произношение расходятся настолько, что это заметно даже на слух. В ней нет ни одного бесспорного корня, который лежал бы на поверхности, а двойное «е» в начале — почти верный признак того, что мы имеем дело с фонетической записью, закрепившейся в документах.

Скорее всего, перед нами вариант фамилии Есе́нкова или Есёнкова. Двойное «е» на письме могло возникнуть из-за того, что носители говора произносили начальный звук с сильным призвуком — так называемое «э» с йотацией, которое в русской графике передаётся буквой «е». В паспортном столе или при переписи эту особенность могли записать буквально: «Ее» вместо одного «Е». Такие случаи — не редкость в северных и вологодских говорах, где «яканье» и «еканье» порой фиксировали с удвоением гласной.

Основа фамилии восходит к имени или прозвищу. Самое прямое объяснение: от канонического имени Есе́ний (разговорная форма от Евсе́ний) или от просторечного Еся — сокращения от Евсе́й, Ефи́м, Елисе́й. В русской ономастике фамилии на -енков типичны для юга России и восточной Украины, но встречаются и в центральных областях. Суффикс -енк- указывал на потомка: Есенков — сын Есени или Есеня. То есть предок носителя фамилии, по всей видимости, был человеком по имени Есеня (или Еся), а фамилия закрепилась в форме родительного падежа множественного числа: «из рода Есенковых».

Менее вероятная, но допустимая версия: связь с диалектным словом «есень» — так в некоторых говорах называли осень. Прозвище Есень мог получить человек, родившийся в эту пору, или тот, кто был связан с осенними полевыми работами. Однако в таком случае фамилия скорее звучала бы как Есенин или Есенев, а форма Есенков тяготеет к личному имени.

География фамилии Еесенкова (и её варианта Есенкова) узкая. В современных телефонных справочниках и базах данных она встречается единично, преимущественно в Вологодской и Архангельской областях. Это подтверждает версию о северном происхождении и о том, что написание с двумя «е» — не опечатка, а местная письменная традиция.

Таким образом, Еесенкова — это не искажённая и не случайная фамилия, а живой след народного произношения, застывший в паспорте. Носитель фамилии может считать, что его предки звались Есенями или Есями и жили на Русском Севере, а сама фамилия — один из тех редких примеров, когда орфография сохранила звучание живой речи.