Фамилия Енчукова — женская форма фамилии Енчуков, и её разбор стоит начать с мужского варианта, который почти наверняка происходит от прозвища или имени Енчук. Это типичная восточнославянская модель с уменьшительным суффиксом -ук/-чук, характерным для украинского, белорусского и южнорусского ареалов. Суффикс -чук (как в Бондарчук, Ковальчук) указывает на «сына» или «малого»: Енчук — «маленький Ен» или «сын Ена». Основа Ен- здесь может быть усечением от крестильного имени Еней, Енох или даже от редкого языческого имени вроде Ен (от «ен» — «он» в древнерусском, но это спорно). В украинской традиции -чук часто прикрепляли к прозвищам, так что Енчук могло означать «сын человека по имени Ен» или «потомок того, кого звали Ен».

Географически фамилия Енчуков тяготеет к югу России и Украине. В документах XIX века она встречается в Курской, Воронежской губерниях и на Кубани — регионах, где активно смешивались русские, украинские и казачьи фамилии. Суффикс -ов в мужской форме (Енчуков) — это уже русская адаптация: если украинец или белорус носил фамилию Енчук, при переходе в великорусскую среду её могли «обрусить», добавив -ов, и получилось Енчуков. Женская форма Енчукова, соответственно, закрепилась как стандартная патронимическая запись в метриках.

Есть и альтернативная, но менее вероятная версия: от тюркского корня «ен» (широкий) или «ян» (душа), но в фамилиях с -чук тюркские основы редки, и обычно они дают другие суффиксы. Скорее всего, предок носителя фамилии был человеком с прозвищем Енчук — возможно, низкорослым или младшим в роду, а фамилия закрепилась за его потомками. Никаких известных дворянских родов или знаменитых носителей под этой фамилией не зафиксировано — это крестьянская или казачья фамилия, типичная для южнорусского пограничья.