Фамилия Ендерюкова — женская форма от Ендерюков, и её разговор лучше начинать с мужского варианта. Основа здесь неочевидна на первый взгляд, и это как раз тот случай, когда фамилия хранит в себе редкое прозвище или диалектное слово.

Вероятнее всего, в основе лежит прозвище Ендерюк. Оно могло образоваться от тюркского корня «енде» или «янды» — в ряде тюркских языков это значит «бок», «сторона», «край». Человека могли прозвать Ендерюком за то, что он жил на краю села, на отшибе, или за какую-то особенность осанки, походки. Суффикс -юк в русских фамилиях тюркского происхождения встречается нечасто, но он характерен для южнорусских и украинских земель, где было сильное влияние тюркских языков. Есть и другая, менее вероятная версия: связь с диалектным словом «ендера» — так в некоторых говорах называли заливной луг или низкое сырое место. Тогда Ендерюк — человек, живший у такого луга.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Ендерюк добавили патронимический суффикс -ов. Получилось Ендерюков — «сын Ендерюка». Женская форма Ендерюкова — это уже грамматическое согласование. Фамилия довольно редкая, её географическое ядро, скорее всего, находится в Поволжье или на юге России, в районах, где исторически смешивались славянское и тюркское население. Сословно носители фамилии, вероятнее всего, были крестьянами или однодворцами.

Отдельно стоит сказать о написании. Буква «ё» в начале фамилии — не случайность. В документах её часто заменяют на «е», и фамилия превращается в Ендерюкова. Но исходный вариант с «ё» подсказывает, что ударение в основе падает на первый слог: Е́ндерюков. Если писать через «е», ударение может сместиться, и смысловая связь с исходным словом станет менее очевидной. Таким образом, фамилия Ендерюкова — это живая метка, указывающая на географическое или личное прозвище предка, уходящее корнями в степные диалекты.