Фамилия Еневатов — редкий пример, в котором нестандартный суффикс перевешивает по значению саму основу. Подавляющее большинство русских фамилий на -ов/-ев образованы от имен или прозвищ, оканчивающихся на согласный: Иванов, Петров. Здесь же мы видим формант -атов, что сразу указывает на нерусское, скорее всего, тюркское происхождение основы. В русской ономастике суффикс -атов характерен для фамилий, возникших из тюркских имен с конечным -ат: например, Салаватов, Булатов. Основа «Еневат» с большой вероятностью восходит к тюркскому личному имени или прозвищу.

Самое правдоподобное объяснение — связь с тюркским корнем «ене» или «ана» (мать, материнский). В татарском и башкирском языках «инәй» — почтительное обращение к матери, старшей женщине. Имя Еневат (или Инәйбат) могло означать «материнское благословение», «дар матери» или даваться ребенку, родившемуся в почтенном возрасте матери. Суффикс -бат/-ват (от арабского «бат» — часть сложных имен) нередок в мусульманских именах: например, Зиннат, Равиат. Со временем имя Еневат могло превратиться в прозвище, а затем, при крещении или переходе в православие, закрепиться как фамилия с русским окончанием -ов.

Менее вероятная версия связывает фамилию с географическим названием. В Поволжье и Приуралье встречаются топонимы с корнем «ен» (река Еневатка, село Енево), но основа «-ват» здесь скорее указывает на принадлежность к роду, а не на местность. Если бы фамилия была топонимической, она чаще звучала бы как Еневский или Еневатовский.

Географически фамилия Еневатов встречается в основном в Поволжье и на Южном Урале — регионах, где веками жили татары, башкиры и русские. Это подтверждает версию о тюркском корне. Социально носители фамилии могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми — в XVI–XVII веках многие татарские мурзы и их потомки получали русские фамилии, сохраняя при этом исходную основу. В любом случае, Еневатов — фамилия, в которой необычный суффикс и редкая основа говорят о смешении культур и давней истории, уходящей в тюркский мир.