Фамилия Енгачев — редкий пример, где географический корень почти наверняка перевешивает антропонимический. В отличие от большинства русских фамилий, образованных от крестильных имён или прозвищ, Енгачев, скорее всего, ведёт начало от названия реки Енга, правого притока Пинеги, что в Архангельской области. В тех краях фамилии на -ев нередко давались по месту жительства: Енга — Енгач — Енгачев. «Енгач» могло быть прозвищем переселенца с этой реки или жителя одноимённого села, которое, вероятно, существовало, но не сохранилось в современных реестрах.

Суффикс -ев указывает на притяжательную модель: «чей?» — Енгачев, то есть сын или потомок Енгача. Сама основа «Енга» — финно-угорского происхождения, как и многие гидронимы Русского Севера. В коми-зырянском языке «ен» означает «бог» или «небо», а в саамских диалектах есть слово «еннг» — «большой». Вряд ли реку называли «божественной» напрямую, скорее значение было «главная, большая река» для местного населения. Позже, при славянской колонизации, название переосмыслили, и оно стало фамильным.

Морфологически фамилия проста: корень «енгач» плюс суффикс -ев. Ударение, судя по аналогиям (Енга́чево — деревня в той же Архангельской области), падает на второй слог: Енга́чев. Вариант с ударением на первый слог возможен, но менее вероятен для северных говоров.

С точки зрения социального контекста, фамилия Енгачев — типично крестьянская, поморская. Никаких следов дворянства или купечества в истории не прослеживается. Носители фамилии — потомки государственных или монастырских крестьян, осваивавших бассейн Пинеги в XVI–XVII веках. Ономастических трудов, прямо разбирающих эту фамилию, нет, но методологически она укладывается в схему, описанную Б. Унбегауном для русских фамилий от географических названий: основа без дополнительного прозвищного смысла, чисто топонимическая.

Если же предположить, что корень не речной, а личный, то «Енга» могло быть тюркским именем (от «енги» — «новый»), но тогда фамилия звучала бы как Енгаев, без суффикса -ч-. Наличие «ч» в основе надёжнее связывать с русским патронимическим суффиксом -ич или с прозвищным формантом, который превращает топоним в именование человека. Поэтому версия с рекой Енга остаётся основной и наиболее доказательной.