Фамилия Епончинцев — редкий пример, когда географическое название стало основой для фамилии не напрямую, а через прозвище, образованное от него. В основе лежит топоним Епанчин (или Епончин) — так в прошлом называли поселения в Сибири и на Урале. Самое известное из них — Епанчинские юрты (ныне часть Тобольска), упоминаемые ещё в XVII веке. Жителя такого места называли епончинец — то есть «выходец из Епончина», а его потомок получал фамилию Епончинцев.

Суффикс -ев здесь присоединился не к личному имени, а к прозвищному обозначению по месту жительства. Модель типична для северных и сибирских фамилий: Чалдонов → Чалдонцев, Вятка → Вяткинцев. Интересно, что в основе лежит не слово «епанча» (плащ), хотя внешнее сходство есть. Епанча — это одежда, и от неё образованы фамилии Епанчин, Епанчинов, но не Епончинцев. Форма «Епончинцев» закрепилась с буквой «о» под влиянием акающего произношения — в говорах «Епанчин» звучало как «Епончин», и на письме это отразилось.

Фамилия почти не встречается за пределами Сибири и Зауралья. По данным переписей XIX века, большинство носителей жили в Тобольской и Пермской губерниях, что подтверждает версию о происхождении от местного топонима. Социальный состав был пёстрым: среди Епончинцев были и крестьяне, и мещане, и казаки. Казачьи корни особенно вероятны — сибирские казаки нередко получали фамилии по названиям станиц и острогов, где несли службу.

Таким образом, фамилия Епончинцев — не про одежду, а про малую родину. Предки носителя, скорее всего, жили в сибирском поселении с названием Епанчин (Епончин) и перебрались в другое место, оставив в фамилии память о своём происхождении.