Фамилия Ермачковы — один из примеров того, как в русской фамильной модели соединились два разных мира: личное имя и народный быт. В основе фамилии лежит имя Ермак. От него образовали уменьшительную форму Ермачок (суффикс -ок здесь указывает на «маленького Ермака», скорее всего — сына), а уже от неё — фамилию Ермачков по стандартной схеме на -ов.

Само имя Ермак — это народная, сокращённая версия целого ряда крестильных имён. Среди них Ермолай (греческое «вестник народа»), Герман (латинское «родной, близкий»), Ермий («принадлежащий Гермесу»), Ермил («из гермесовой рощи»), Гермоген («из рода Гермеса») и Иеремия (древнееврейское «возвышенный Богом»). Такое сжатие было обычным делом в повседневной речи: длинные церковные имена сокращали до коротких и удобных форм, которые потом закреплялись в фамилиях.

Но есть и другая, не менее вероятная версия происхождения. В русских говорах ермаком называли небольшой ручной жёрнов для помола зерна. В крестьянском хозяйстве такая вещь была на виду, и прозвище Ермак легко мог получить мельник или тот, кто постоянно работал с мукой. Если это так, то фамилия Ермачковы идёт не от имени, а от ремесла, и её носители — потомки человека, чья профессия дала ему прозвище.

Словообразовательная модель здесь простая: основа Ермач- (от Ермачок) плюс суффикс -ов, показывающий принадлежность («чей?» — Ермачков). То, что в фамилии сохранился уменьшительный суффичок, — не случайность, а точный указатель на родство: так называли младшего в семье или сына.

Точное место и время появления фамилии Ермачковы установить трудно — такие фамилии складывались в разных регионах постепенно, в течение XVI–XVII веков. Однако ясно, что перед нами не поздний искусственный вариант, а живая народная фамилия, которая могла возникнуть и в среде крестьян-земледельцев, и в среде посадских людей, носивших церковные имена в сокращённом виде.