Фамилия Ермаченко — это пример украинской или белорусской модели образования фамилий с патронимическим суффиксом -енко. В буквальном смысле она означает «сын Ермака» или «потомок Ермака». Основа фамилии — имя Ермак, которое в народной традиции стало сокращённой, обиходной формой крестильного имени Ермолай.

Имя Ермолай пришло на Русь из греческого языка и означает «вестник народу». Церковным покровителем этого имени считается святой священномученик Ермолай — пресвитер Никомидийский, который за проповедь христианской веры был обезглавлен в IV веке. На Руси с днём памяти этого святого (Ермолаев день) связывали народные приметы: считалось, что если в этот день муравьи начинают активно увеличивать муравейники, то зима будет холодной.

Имя Ермак было широко распространено в народе, особенно в казачьей среде. Самый известный его носитель — атаман Ермак Тимофеевич, покоритель Сибири. Однако фамилия Ермаченко не обязательно связана с ним напрямую: её могли дать любому человеку по имени Ермак. Суффикс -енко характерен прежде всего для восточных и центральных регионов Украины, а также для южных областей России, где исторически было сильно украинское влияние. Поэтому географически фамилия Ермаченко чаще всего встречается на территории современной Украины, а также в пограничных с ней российских областях.

В отличие от великорусских патронимов на -ов (Ермаков), фамилии на -енко указывали не на принадлежность отцу, а на происхождение от рода — то есть на более отдалённое родство. Таким образом, первый носитель фамилии Ермаченко, скорее всего, был сыном или потомком человека по прозвищу Ермак, которое, в свою очередь, восходит к крестильному имени Ермолай.