Фамилия Ермекбаева восходит к казахскому мужскому имени Ермек («забава»). Компонент «бай» имеет значение «богатый; господин». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Ермекбаевых можно лишь на основании генеалогических исследований.