Фамилия Ермекова — одна из тех, где ключ к происхождению лежит в мужском имени, а не в прозвище или ремесле. В её основе лежит казахское имя Ермек, которое переводится как «забава» или «увеселение». Родители, давая такое имя сыну, вкладывали в него пожелание лёгкого нрава и жизнерадостности — чтобы человек рос весёлым и приносил радость окружающим. Это самая прямая и распространённая версия.

Существует и альтернативная гипотеза, хотя она заметно уступает первой в убедительности. Согласно ей, в основе фамилии могло лежать прозвище Ермек, образованное от общетюркского глагола со значением «разрывать, рвать». Если принять эту версию, то прозвище могло указывать на род занятий — например, на человека, занятого в обработке волокна, кожи или иного материала, требующего разрывания. Однако такая этимология остаётся спорной, и большинство ономастов склоняются к имени как к первичному источнику.

Словообразовательная модель фамилии проста и типична для русской традиции оформления тюркских имён: суффикс -ов (в женской форме -ова) присоединяется к основе Ермек. Так фамилия приобрела стандартное для славянской документации окончание, указывающее на принадлежность роду человека по имени Ермек.

Среди носителей фамилии есть люди, оставившие заметный след в науке. Например, Магавья Алимханович Ермеков (1921 года рождения) — доктор геолого-минералогических наук, профессор, член-корреспондент и академик Национальной академии наук Республики Казахстан. Его биография — один из немногих задокументированных следов фамилии в открытых источниках.

Точное место и время возникновения рода Ермековых остаются предметом генеалогических изысканий. Фамилия могла закрепиться в разных регионах Казахстана и сопредельных территорий в разное время, в зависимости от того, когда и как имя Ермек попало в официальные документы и закрепилось за потомками.