Фамилия Ермохина образована от имени Ермоха — уменьшительной формы целого ряда крестильных имён. Среди возможных источников: Ермолай (с греческого — «вестник народа»), Герман (от латинского «родной, близкий»), Ермий («принадлежащий Гермесу»), Ермил («из гермесовой рощи»), Гермоген («из рода Гермеса») или Иеремия (с древнееврейского — «возвышенный Богом»). Выбрать единственную основу сложно: в народной среде разные полные имена могли стягиваться в одну обиходную форму.

Сама модель фамилии — на -ин — указывает на принадлежность: Ермохин значит «сын Ермохи» или «из дома Ермохи». Такие фамилии типичны для северных и центральных областей России, где преобладал притяжательный суффикс -ин, в отличие от южного -ов/-ев. В говорах имя Ермоха могло звучать и как Ермошка, Ермак, Ермилка — все они дали начало самостоятельным фамилиям, но Ермохина держится ближе к исходной уменьшительной форме.

Скорее всего, основатель рода Ермохиных был человеком из простого сословия: краткие обиходные имена в XVI–XVII веках чаще закреплялись за крестьянами, посадскими людьми или казаками, а не за дворянством. Фамилия не встречается в родословных книгах знати, что косвенно подтверждает её «низовое» происхождение. В переписных книгах XVII века носители имени Ермоха встречаются в вятских и пермских землях — там же позже фиксируется и фамилия.

Таким образом, фамилия Ермохина — это типичный пример русской «полуотчества» от разговорной формы церковного имени, закрепившейся в крестьянской среде. Потомок человека по имени Ермоха со временем получил фамилию, которая без изменений дошла до наших дней.