Фамилия Ержакыпов — редкая для России и отчётливо указывает на центральноазиатские корни. Она образована по типичной для русской среды модели — с помощью патронимического суффикса -ов, который в XIX–XX веках «обрусел» множество фамилий тюркского происхождения. Основа здесь — имя Ержакып, которое представляет собой казахскую или киргизскую форму арабского имени Аржакып (в русской передаче — Аржакип). Если разобрать имя по составляющим, то «Ер» в тюркских языках означает «мужчина», «герой», «молодец», а «Жакып» — это местный вариант библейского имени Якуб (Иаков). Таким образом, Ержакып можно перевести как «мужественный Якуб» или «герой Якуб».

Модель образования фамилии проста: к личному имени Ержакып добавили русский суффикс -ов, который в славянской традиции указывает на принадлежность («чей?» — «сын Ержакыпа»). Это типичный случай, когда в XIX — начале XX века, при проведении переписей или выдаче паспортов, носителям тюркских имен присваивали фамилии по отцу, используя русский формант. Поэтому предки первых Ержакыповых, скорее всего, были казахами или киргизами, а сама фамилия закрепилась на территории современного Казахстана или Кыргызстана, откуда позже могла распространиться в соседние регионы.

В отличие от многих других фамилий на -ов, у Ержакыпов нет связи с русскими ремёслами, прозвищами или географическими названиями. Её уникальность — в двойном культурном слое: арабское имя через тюркское посредничество попало в русскую паспортную систему. Фамилия довольно редкая, и её носители, скорее всего, принадлежат к нескольким родственным семьям, разбросанным по постсоветскому пространству. Встречается она преимущественно в Казахстане, реже — в России, в регионах с казахской диаспорой.

С точки зрения ударения, наиболее логично ставить его на второй слог: Ержакы́пов, хотя в устной речи возможны варианты. Примечательно, что в исходном имени «Жакып» звук «ж» передаёт мягкое «дж», характерное для казахского произношения, но в русском написании оно закрепилось как твёрдое «ж». Это ещё одно свидетельство того, что фамилия прошла через этап устной фиксации, прежде чем попасть в документы.