Фамилия Ешелькин — один из тех случаев, где за привычным русским окончанием скрывается нерусская основа. Суффикс -ин однозначно указывает на принадлежность: «чей?» — Ешелькин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Ешелька. А вот само прозвище Ешелька — это, скорее всего, уменьшительная форма от тюркского имени Еш, Еше или Еш-Али. В тюркских языках «еш» означает «товарищ», «друг», «спутник», и такие имена давали с пожеланием, чтобы человек был верным и надёжным. В русских говорах, особенно в Поволжье и на Южном Урале, где было активно татаро-башкирское и чувашское влияние, подобные имена легко адаптировались: к основе добавляли русский уменьшительный суффикс -к(а), а затем патронимический -ин.

Версия о чисто русском происхождении от слова «ешель» (якобы диалектного названия рыбы или птицы) не выдерживает критики: ни в одном словаре русских говоров такого слова нет. Зато прозвище Ешелька и фамилия Ешелькин фиксируются в документах XVI–XVII веков на территории современной Нижегородской области и Татарстана, что совпадает с зоной активных русско-тюркских контактов. Например, в писцовых книгах Казанского уезда встречаются крестьяне с именем Ешка (от Еш-Али) — именно от таких имён и пошли фамилии на -кин.

Таким образом, предок носителя фамилии Ешелькин, вероятно, был обрусевшим татарином, башкиром или чувашом, взявшим при крещении или в быту уменьшительную форму своего тюркского имени. Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская, распространённая в основном в тех же регионах — в Чувашии, Татарстане, Ульяновской и Самарской областях. Встречаются варианты написания Ешелккин (с удвоенной «к»), но они редки и, скорее всего, являются результатом ошибок в документах.