Фамилия Эйбова — женская форма от Эйбов, и её происхождение стоит искать не в славянских, а в тюркских или, возможно, финно-угорских корнях. Основа фамилии — личное имя или прозвище Эйб (или Айб). В тюркских языках «айып» (через «ай» и «ып») означает «стыд», «позор», но такое прозвище давали не как оскорбление, а как охранительное имя: считалось, что «плохое» имя отпугнёт злых духов и защитит ребёнка. Вторая версия отсылает к тюркскому «айыб» — «недостаток», «изъян», что тоже могло стать прозвищем человека с физической особенностью.

Модель образования типична для русских фамилий, усвоенных из иноязычной среды: к основе Эйб добавили патронимический суффикс -ов (в женском варианте -а). Такая схема характерна для регионов Поволжья, Урала и Сибири, где русские фамилии нередко возникали у татар, башкир, чувашей или мордвы. Встречаются и однокоренные фамилии: Эйбов, Айбов, Эйбенко — все они восходят к одному корню, но разошлись по разным диалектам и этническим группам.

С географией фамилии всё скромно: Эйбова — редкая фамилия, её носители в основном сосредоточены в Татарстане и Башкортостане, а также в Оренбургской области. В дореволюционных переписях она почти не фиксируется, что говорит о позднем закреплении — вероятно, в XIX веке, когда крещёные татары и башкиры получали фамилии по отцу.

Суффикс -ов указывает на то, что предок носителя фамилии был, скорее всего, крестьянином или мещанином — дворянские фамилии с такой основой в русской среде не встречаются. Таким образом, Эйбова — это «дочь (или жена) Эйба», где Эйб — древнее охранительное прозвище, которое должно было уберечь своего хозяина от бед.