Фамилия Фандюшкина — редкий пример того, как народная, разговорная форма имени со временем закрепилась в качестве официального родового прозвания. В её основе лежит имя Фандюшка, которое, в свою очередь, является производной, уменьшительно-ласкательной формой от более полного имени.

Здесь мы сталкиваемся с развилкой из двух версий, и обе имеют право на существование. Первая связывает Фандюшку с крестильным именем Фаддей. В переводе с греческого оно означает «достойный похвалы» — от греческого слова «тадеос». Вторая версия отсылает к русифицированной форме арабо-персидского имени Фандей. Такое имя трактуется более поэтично: «преданный всем сердцем науке» или «отдающий всю душу науке».

Какой версии стоит доверять? Ономасты чаще склоняются к первой, греческой, поскольку имя Фаддей было широко распространено на Руси благодаря святцам. Арабское имя Фандей — большая редкость, и его появление в русском быту маловероятно. Однако обе версии едины в главном: родители, нарекая сына Фандюшкой, вкладывали в это пожелание ума, прилежания и мудрости. Они словно программировали ребёнка на успехи в учёбе, желая видеть его прилежным учеником или даже учёным.

Сама фамилия образована по классической русской модели: к основе Фандюшк- добавился суффикс притяжательного прилагательного -ин, а затем и типичное женское окончание -а. Так что Фандюшкина буквально означает «дочь (или жена) Фандюшки». Мужской вариант — Фандюшкин.

Интересно, что фамилия сохранила в себе именно просторечную, домашнюю форму имени. Это говорит о том, что предки носителей фамилии были людьми не книжными, а скорее из крестьянской или мещанской среды, где полное церковное имя Фаддей в быту вытеснялось коротким и тёплым Фандюшка. Такая модель словообразования — от уменьшительного имени, а не от полного — типична для русских фамилий, формировавшихся в XV–XVII веках.