Фамилия Фандюшина образована от прозвища Фандюша, которое восходит к украинскому слову «фанда» — «длинный кнут». В таком случае Фандюшей могли называть пастуха, худого человека или мастера по изготовлению кнутов. По другой версии, данная фамилия ведет свое начало от производной формы арабо-персидского мужского имени Фандей - Фандюша, которое переводится на русский язык как «преданный всем сердцем науке; отдающий всю душу науке». Вероятно, родители, нарекая ребёнка таким именем, желали своему сыну стать прилежным учеником, образованным, эрудированным человеком. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Фандюша, со временем получил фамилию Фандюшина.