Фамилия Фархиуллина — женская форма, мужской вариант — Фархиуллин. Она тюркского происхождения и почти наверняка восходит к арабскому имени Фархиулла. Это имя составное: «фарх» (радость, счастье, восторг) и «улла» (Аллах). В буквальном переводе — «радость Аллаха» или «тот, кто радует Аллаха». Такая модель образования имён — с корнем «фарх» и компонентом «улла» — типична для мусульманских народов Поволжья и Приуралья, особенно татар и башкир.

Суффикс «-ин» в русской передаче указывает на принадлежность. Фамилии на «-ин» в тюркской среде часто возникали при документальном оформлении в Российской империи: отца записывали по имени, а детям давали фамилию по отцу с русским патронимическим суффиксом. Фархиуллин буквально означает «сын Фархиуллы» или «из рода Фархиуллы». Это не прозвище по ремеслу или внешности, а прямая отсылка к личному имени предка-мужчины, который, вероятно, был человеком верующим и получил имя с религиозным смыслом.

Географически фамилия распространена среди татар (особенно казанских и мишарских), реже встречается у башкир. Встречаются варианты написания — Фархиулов, Фархиуллин, но форма с двойным «л» и окончанием «-ин» — самая частая. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках можно найти записи с более арабизованной орфографией, например, Фархиулла или Фархиуллин, что говорит о сохранении исходного звучания.

Сословная принадлежность носителей фамилии неоднородна. Среди Фархиуллиных были и крестьяне, и торговцы, и муллы. Встречаются упоминания о Фархиуллиных в Оренбургской, Уфимской и Казанской губерниях — в тех регионах, где традиционно жили татары-мусульмане. Фамилия не древняя, в том смысле, что её массовое закрепление произошло в XVIII–XIX веках, когда государство начало фиксировать фамилии у нерусских народов. Но имя-основа Фархиулла могло бытовать веками.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Фархутдинов, Фархшатов — то Фархиуллина стоит особняком из-за прямого включения имени Бога в основу. Это придаёт фамилии отчётливый религиозный оттенок: предок, давший ей начало, скорее всего, был набожным человеком или получил имя в честь религиозного деятеля.