Фамилия Фаррухшин — редкий случай в русском ономастиконе, и её разбор сразу уводит нас за пределы привычных славянских корней. В основе лежит арабское имя Фаррух, которое через персидское посредничество попало в тюркские языки. Значение имени — «счастливый», «благословенный», «приносящий удачу». В мусульманском мире это имя известно в разных формах: Фаррух, Фаррухзод, Фаррухон. К нам оно пришло, скорее всего, через татарскую или башкирскую среду, где арабо-персидские имена были широко распространены.

Суффикс -ин в фамилии указывает на русскую модель образования от тюркской основы. По правилам русской грамматики, фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а, -я или на согласный: Фаррухша → Фаррухшин. Здесь мы видим усечение конечного гласного: от полного имени Фаррухша (уменьшительно-ласкательная форма с тюркским аффиксом -ша) или от прозвища Фаррухша остаётся основа Фаррухш-, к которой добавляется русский патронимический суффикс. Таким образом, Фаррухшин буквально означает «сын Фаррухши» или «потомок Фаррухши».

Географически фамилия тяготеет к регионам с компактным проживанием татар и башкир — Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская, Самарская области. Встречается она крайне редко, что говорит о недавнем закреплении в русской антропонимии: вероятно, фамилия оформилась в XIX–XX веках, когда у татар и башкир начали массово фиксировать фамилии по русскому образцу. До этого люди пользовались отчествами или родовыми прозвищами, и Фаррухша могло быть именно таким прозвищем — ласковым именованием счастливого, удачливого человека.

Сравнение с похожими фамилиями — Фаррухов, Фаррухзода — показывает, что Фаррухшин стоит особняком. Вариант на -ов более характерен для тюркских фамилий, где основа оканчивается на согласный (Фаррух → Фаррухов), а -ин здесь — результат русского грамматического приспособления. Если фамилия Фаррухов прямо указывает на предка по имени Фаррух, то Фаррухшин подразумевает промежуточную форму Фаррухша, что может свидетельствовать о более тесном бытовом общении в среде, где имя сокращали и ласкали. По сути, это микроистория одной семьи: кто-то из предков был настолько известен как «Фаррухша», что это прозвище закрепилось за всем родом.