Фамилия Фартышев — редкий случай в русской ономастике, где основа прозвища не лежит на поверхности и не связана с очевидными ремёслами или внешностью. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать словообразовательную модель. Суффикс -ев указывает на притяжательное значение «сын Фартыша» или «человек из семьи Фартыша». Само же прозвище Фартыш, скорее всего, образовано от глагола «фартить» — в русских говорах это значит «везти, удаваться, идти впрок». Фартышем могли прозвать удачливого человека, баловня судьбы, того, кому постоянно везло в делах, охоте или торговле.

Версия с корнем «фарт» (удача) — основная и самая правдоподобная. В диалектах русского Севера и Сибири слово «фарт» означало не просто везение, а конкретную добычу промысловика: «фарт на соболя» — удачный промысел. Соответственно, Фартыш — это прозвище охотника или рыбака, которому сопутствовала удача, либо просто счастливчика. Менее убедительна версия о связи с тюркскими корнями (например, от «фарт» — «превосходный», «отличный»), так как суффикс -ыш типичен именно для русской прозвищной модели (Малыш, Голыш, Крепыш).

География фамилии Фартышев сегодня размыта, но ранние упоминания тяготеют к северным и центральным губерниям России. В писцовых книгах XVII века встречаются крестьяне и посадские люди с прозвищем Фартыш, что говорит о простонародном, а не дворянском происхождении фамилии. Фартышевы, скорее всего, были не знатными боярами, а вольными или дворцовыми крестьянами, промышленниками или ремесленниками, которых природа наградила прозвищем за везение.

В написании фамилии стоит обратить внимание на твёрдый звук [т] перед суффиксом: Фартышев, а не Фартишев. Это закрепляет диалектное произношение слова «фарт» с твёрдым окончанием. Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Фартышев — более редкая форма, чем, например, Фартов или Фартунов, что делает её ценной для локальной истории: носители такой фамилии почти наверняка происходят из одной узкой местности, где прозвище закрепилось именно в такой огласовке.