Фамилия Фарус — редкий случай, когда основа, скорее всего, не славянская, а тюркская или арабская. В русском языке она выглядит как искусственно «обрусевшая»: суффикс -ов отсутствует, окончание нулевое, что нетипично для исконно русской фамилии. Чаще всего такие фамилии либо застыли в форме прозвища, либо пришли из других языков без переделки.

Самая вероятная версия — происхождение от арабского имени Фарус (فاروس), что значит «всадник» или «рыцарь». В исламской культуре это имя давали мальчикам, желая воспитать смелого воина. Через татар или другие тюркские народы имя могло попасть в русскую среду как прозвище: Фарус — человек, который хорошо держится в седле, либо просто храбрец. Фамилию могли дать либо первому носителю такого прозвища, либо его потомкам, когда прозвище закрепилось за родом.

Вторая, менее распространённая версия — топонимическая. Фарус — это греческое название маяка на острове Фарос в Александрии. В переносном смысле прозвище Фарус могли дать человеку высокого роста («как маяк») или тому, кто служил смотрителем маяка, если такое было возможно в южных регионах России. Однако эта версия слабее: слишком книжная и редкая для бытового прозвища.

Географически фамилия Фарус встречается в основном на юге России и в Поволжье — в тех регионах, где сильны татарские и тюркские корни. Встречается и у крымских татар. В центральной России она практически не фиксируется.

По модели образования фамилия стоит особняком: она не получила типичного русского суффикса -ов/-ев, -ин. Это говорит о том, что носители долго сохраняли прозвищную форму, либо фамилия была записана в документах именно так — без адаптации. Иногда встречается вариант Фарусов, но он вторичен и возник уже под влиянием русской канцелярии.