Фамилия Фатхуллина восходит к восточному мужскому имени Фатхулла. Таким образом, это имя переводится на русский язык как «победа принадлежит Аллаху» или «победу дает Аллах». Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Фатхуллиных можно лишь на основании генеалогических исследований.