Фамилия Фаустин — редкий случай в русском ономастиконе. В ней нет ни славянского суффикса -ов или -ин, ни типичного прозвища от ремесла или внешности. Это прямая, почти без изменений, заимствованная форма личного имени. Основа — латинское имя Faustinus, которое в свою очередь образовано от прилагательного faustus («счастливый», «благоприятный»). В римской традиции так называли детей в пожелание удачи, а в христианстве это имя носили несколько ранних святых и мучеников.

Как фамилия Фаустин могла попасть в русскую среду? Вероятнее всего, через духовное сословие. В семинариях XVIII—XIX веков было принято давать будущим священникам «благозвучные» фамилии по церковному календарю или в латинском обличье. Семинарист, которого в миру звали, скажем, Фаустом или Фаустином (по святцам), мог получить фамилию Фаустин уже как наследственную. Второй путь — через католическое влияние на западных окраинах Российской империи (Польша, Белоруссия, Украина), где имя Faustyn было в ходу, и его русифицировали в фамилию.

Географически фамилия не привязана к какому-то одному региону России, но встречается крайне редко. Поскольку в основе лежит латинский корень, а не местное прозвище, она не расскажет, скажем, о профессии предка. Зато она прямо указывает на книжное, церковное происхождение, а возможно, и на польские корни рода. Двойников у фамилии почти нет: однокоренные русские фамилии вроде Фаустов или Фаустинов встречаются, но уже с русскими суффиксами, а Фаустин остался в исходной форме без добавления -ов.

Написание фамилии устойчивое — через «а» в первом слоге и с двумя «и»: Фаустин. Вариант с одной «и» (Фаустин) возможен как ошибка при записи, но не как историческая норма. В целом, носитель фамилии может быть уверен: его предки либо имели прямое отношение к церковной среде, либо происходили из польско-литовских земель, где латинское имя Faustyn было привычным.