Фамилия Филенкова образована от прозвища Филенок. В его основе лежит заимствованное из немецкого языка слово «филенка» (Füllung), которое означает тонкую доску или фанеру, вставляемую в какую-либо раму (дверную, паркетную и т. Вполне вероятно, что основатель рода Филенковых занимался столярными работами. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Филенок, со временем получил фамилию Филенкова.