Фамилия Филоретов — редкий случай, когда за основу взято не имя и не прозвище, а притяжательное прилагательное, образованное от названия монастыря или храма. Если обычные «поповские» фамилии (Попов, Пономарёв) указывали на должность предка, то Филоретов говорит о другом: носитель, скорее всего, был крестьянином или мещанином, приписанным к церкви или селу, носившему имя святого Филорета.

Словообразовательная модель прозрачна: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — Филоретов). Основа — имя Филорет. В русской православной традиции это неканоническая, но употребительная форма греческого имени Филарет (др.-греч. φιλάρετος — «любящий добродетель»). Церковь канонизировала нескольких святых с этим именем, самый известный — Филарет Милостивый (VIII век). На Руси имя давали в честь него, а со временем возникли и топонимы: село Филаретово, Филаретовка, а также храмы, посвящённые святому. В народном произношении «Филарет» легко превращалось в «Филорет»: через аканье или под влиянием местных говоров.

Географически фамилия Филоретов тяготеет к центральным и северным губерниям России, где были распространены храмы Филарета Милостивого. Встречается редко — в десятках, а не сотнях семей. По сословной принадлежности предки были, как правило, государственными крестьянами или однодворцами, реже — выходцами из духовенства (если семья жила при конкретном храме). Второй вариант — фамилия могла быть искусственной, семинарской: её давали ученику, который выделялся добродетелью или просто нёс фамилию по имени святого, в день памяти которого родился.

В написании возможна путаница: вариант Филаретов (через «а» в первом слоге) встречается, но Филоретов — не ошибка, а исторически сложившаяся форма. Сравните с фамилиями Филатов, Филатьев, где та же основа, но с другим суффиксом. Если ваша фамилия — Филоретов, то корни, скорее всего, ведут в крестьянскую среду XIX века, в местность, где почитали святого Филарета, а имя его носил местный храм или село.