Фамилия Фомашина образована от мужского крестильного имени Фома, которое в переводе с арамейского означает «близнец». В основу фамилии легла уменьшительно-ласкательная форма этого имени — Фомаша. Так в быту могли называть и взрослого мужчину, и ребёнка, и именно эта форма, а не полное имя, закрепилась в фамилии. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Фомашина — это «дочь или жена Фомаши», а в более широком смысле — человек из рода Фомашиных.

Стоит развести два разных значения, которые могли лечь в основу фамилии. Первое — прямое, от имени Фома. Выражение «Фома неверующий» стало нарицательным для недоверчивого слушателя, но к фамилии оно имеет лишь косвенное отношение: это библейский контекст, а не прозвище конкретного предка. Второе значение — нарицательное. В русских народных говорах Фомой нередко называли простоватого, вялого, медлительного человека. Это прозвищное значение вполне могло закрепиться за основателем рода независимо от его крестильного имени.

Скорее всего, предки Фомашиных были выходцами из рабочей или крестьянской среды. На это указывает сама модель фамилии: уменьшительная форма имени плюс суффикс -ин характерна для простонародной среды, тогда как дворянские фамилии чаще образовывались от полных форм с суффиксом -ов/-ев. В документах XVII–XIX веков крестьяне и посадские люди часто записывались именно по такой схеме — от того имени, каким их звали в деревне, а не по официальному полному имени.

Интересно, что фамилия Фомашина встречается реже, чем однокоренные Фомин или Фомкин. Это объясняется тем, что форма Фомаша была менее распространена, чем просто Фома или Фомка. В некоторых регионах, особенно на севере и в центральной России, такие «уменьшительные» фамилии на -ин от имён на -ша (Фомаша, Тимоша, Яша) фиксировались довольно часто, но в целом оставались в меньшинстве по сравнению с фамилиями на -ов.

Если говорить о значении, то фамилия Фомашина двойственна. С одной стороны, она хранит память о конкретном человеке по имени Фомаша, которого так звали домашние и соседи. С другой — не исключено, что прозвище Фомаша дали предку за его характер: простодушие, неторопливость или даже некоторую наивность. Обе версии имеют право на существование, и без дополнительных генеалогических данных нельзя сказать, какая из них точнее для конкретной семьи.