Фамилия Форафонова — женская форма, а её мужской вариант Форафонов. Это редкая фамилия, и её происхождение неочевидно на первый взгляд. В основе, скорее всего, лежит не церковное имя, а искажённое, народное произношение крестильного имени. Чаще всего здесь видят переделку имени Ферапонт (греч. «слуга, спутник»). В русских говорах имя Ферапонт упрощали до Фарапон, Форапон, а затем и до Форафон. Такое «обкатывание» имён — обычное дело: сложные греческие звуки заменялись на более привычные для русского уха, а безударные гласные путались.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования отчества. Форафонов — буквально «сын Форафона». То есть предок носительницы фамилии был человеком по имени Форафон (народная форма Ферапонта). Фамилия могла появиться в среде, где было много полуграмотных переписчиков и писцов, фиксировавших имя на слух, а не по святцам.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с греческим словом «фора» (ношение, подать) или с диалектным глаголом «форафонить» (говорить вздор, пустословить). Но эти гипотезы слабы: прозвище от глагола «форафонить» дали бы человеку с определённым поведением, но такая основа в фамилиях почти не встречается, а греческое «фора» не дало бы суффикса -он. Поэтому версия с именем Ферапонт — основная и самая правдоподобная.

Географически фамилия встречается в основном в центральных и северных областях России, где в прошлом было распространено имя Ферапонт и его просторечные варианты. Встречаются и однокоренные фамилии: Ферапонтов, Фарафонов, Фарафонтов, Форафонтьев. Форафонова — один из самых редких вариантов этого гнезда, что говорит о локальном бытовании конкретной формы имени.