Фамилия Франциян — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение лежит не в географическом названии, а в прозвище. Основа фамилии — слово «француз» в его старой, диалектной или просторечной форме «францы́». Суффикс -ян указывает на восточнославянскую, скорее всего, южнорусскую или украинскую модель образования. В русских фамилиях суффикс -ян (как в Бондаренко, Руденко) — это уменьшительная или патронимическая форма, но здесь он работает иначе: он добавляется к прозвищу, чтобы обозначить «сына того, кого прозвали Францем» или просто «человека, связанного с Францем».

Прозвище Франц (или Француз) в допетровской и послепетровской Руси давали не только выходцам из Франции. Чаще так называли человека, который перенимал западные манеры, одевался по-европейски, говорил с иностранным акцентом или просто брился на западный манер — в отличие от бородатых соотечественников. В среде крестьян и посадских такое прозвище могло быть ироничным: «французом» дразнили щёголя, человека с претензией на европейскую утончённость, а иногда — просто бледного или светловолосого парня, напоминавшего иноземца.

Фамилия Франциян — недворянская, а скорее крестьянская или мещанская. Она встречается в основном на юге России и в восточных областях Украины, где суффикс -ян получил широкое распространение под влиянием греческих и армянских фамилий. В отличие от французских фамилий на -ан (вроде Дюран), здесь окончание — чисто славянский патронимический суффикс, а корень — заимствованное прозвище. То есть носитель фамилии Франциян — потомок не француза, а русского человека, которого окрестили Францем за пристрастие к чему-то западному или за внешность.

Редкость фамилии объясняется тем, что прозвище Франц было не слишком распространено, а форма на -ян закрепилась только в определённых регионах. Других версий — например, связи с кавказскими народами или с топонимом — у этой фамилии нет. Это чистый пример того, как ироничное или описательное прозвище закрепилось в родовом имени и передалось через века.