Фамилия Фундеряко — редкий случай, когда украинская модель образования (суффикс -як) наложилась на основу, звучащую не по-славянски. В отличие от распространённых фамилий на -енко или -ук, форма на -як (-яко в русской передаче) встречается реже и часто указывает на западные регионы Украины — Волынь, Подолье или Галичину. При этом суффикс -як обычно образовывал фамилии от прозвищ, имён или названий занятий: Бондаряк (от бондарь), Шевченко — другая модель, а Фундеряко — явно от прозвища Фундер или Фундера.

Самая правдоподобная версия связывает основу с немецким или еврейским словом «фундер» — в немецком Finder означает «находчик», а в идише פֿונדער (funder) — «основатель», «учредитель» или «тот, кто находит средства». В южнорусских и украинских говорах XIX века «фундер» могло означать предприимчивого человека, устроителя дел, а иногда — просто «пройдоху» или «ловкача». Прозвище Фундер давали либо пришлому немцу-ремесленнику, либо местному еврею, занимавшемуся торговлей или посредничеством. От него образовалась форма Фундеря — с характерным украинским окончанием -я, обозначающим лицо (ср. Гриця, Петря), а затем фамилия Фундеряко — буквально «сын или потомок Фундери».

Есть и более прозаичная версия: в некоторых говорах «фундер» — искажённое «фунт» (мера веса), и прозвище могли дать человеку маленького роста или, наоборот, грузному. Но она слабее, потому что фамилии от мер веса обычно образуются иначе (Фунтиков, Фунтов).

Сословная принадлежность носителей Фундеряко, скорее всего, была мещанской или крестьянской — фамилия не княжеская и не дворянская, суффикс -яко характерен для простонародья. Географически фамилия встречается в основном в Хмельницкой, Винницкой и Житомирской областях Украины, а также среди потомков переселенцев на Кубани и в Ставрополье. В России фамилия крайне редкая, почти не фиксируется за пределами южных регионов. Написание с конечным -о (Фундеряко, а не Фундеряк) — результат русификации украинской формы при записи в паспорта и метрики.