Фамилия Фундук — один из тех случаев, когда носитель фамилии почти наверняка имеет дело с прозвищем, а не с «растительным» названием. Вопреки первому впечатлению, корень здесь не обязательно связан с орехом. В русской ономастике фамилии, образованные от названий деревьев и плодов (Дуб, Сосна, Вишня), обычно закреплялись за людьми по внешнему сходству или по месту жительства — например, «Фундук» могли прозвать человека с круглой головой, плотным телосложением или, наоборот, с пристрастием к лакомству. Однако есть и другая, более вероятная версия.

В украинских и южнорусских говорах слово «фундук» (или «фундик») имело переносное значение — так называли невысокого, коренастого, крепкого мужчину, «орешек», которого трудно сломать. Именно в этом прозвищном значении фамилия получила распространение на территории современной Украины и в Черноземье. Фамилия образована без суффикса, по так называемой «чистой» модели: прозвище Фундук стало фамилией напрямую. Такое оформление характерно для украинской и белорусской традиции, где фамилии на -ук, -енко встречаются чаще, но и бессуффиксные варианты не редкость.

Менее распространённая, но интересная версия отсылает к тюркским корням. В крымскотатарском языке «фундук» — это заимствование из греческого (pontikos, «понтийский орех»), но как личное имя или прозвище оно могло закрепиться у народов, торговавших орехами или живших в местах их произрастания — в Крыму и Причерноморье. В этом случае фамилия Фундук могла указывать на род занятий: торговец орехами или садовод.

Встречаемость фамилии невысокая, она гораздо реже, чем, скажем, Фундуков или Фундучный. Географически фамилия тяготеет к югу России и востоку Украины — Харьковская, Донецкая области, Краснодарский край. В дореволюционных источниках фамилия фиксируется в основном среди мещан и крестьян, что подтверждает её прозвищное, а не аристократическое происхождение. Среди носителей нет громких исторических фигур, что только подчёркивает народный, бытовой характер фамилии: её давали за характер или внешность, а не за заслуги.