Фамилия Фундыга — редкая и неочевидная для этимологического разбора. В ней нет привычных для русских фамилий суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу указывает на её возможное нерусское происхождение или на то, что она застыла в форме прозвища, не пройдя полную русификацию.

Наиболее вероятная версия связывает основу «фундыг-» с украинским или белорусским диалектным словом. В юго-западных говорах «фундыга» могло означать нечто вроде «неуклюжий, неповоротливый человек» или «увалень». Слово это, скорее всего, восходит к польскому «funda» — «праща» или «сумка», но в переносном смысле приобрело пренебрежительный оттенок. Таким образом, прозвище Фундыга могли дать медлительному или нерасторопному крестьянину.

Менее правдоподобна, но возможна связь с румынским или молдавским «fundă» — «лента, бант». В этом случае фамилия могла бы указывать на ремесло: предок, например, торговал лентами или делал банты. Однако для территории Украины и Беларуси, где фамилия встречается чаще, диалектная версия с отрицательной характеристикой выглядит убедительнее.

Географически фамилия Фундыга привязана к западу современной Украины (Волынь, Ровенская область) и югу Беларуси. В дореволюционных метрических книгах она встречается в основном среди мещан и крестьян, что подтверждает её «низовое» происхождение — от прозвища, а не от имени или профессии.

Словообразовательно фамилия стоит особняком: она образована напрямую от прозвища без добавления патронимического суффикса. Такая модель характерна для украинских и белорусских фамилий (сравните: Швачка, Нечитайло, Паливода). Поэтому носитель фамилии Фундыга может с высокой вероятностью считать своими предками выходцев из западнорусских земель, получивших своё прозвище за внешность или характер, а не за род занятий.