Фамилия Фунина образована от мужского имени Фуня — так в старину в быту сокращали крестильное имя Афанасий. Само имя Афанасий пришло из греческого языка и восходит к слову «атанасия», что значит «бессмертие». Поэтому, хотя прозвище Фуня звучит просто и по-домашнему, за ним стоит древний и торжественный смысл.

История покровителя этого имени добавляет фамилии глубины. Среди святых покровителей — преподобный Афанасий Печерский, подвизавшийся в Киево-Печерском монастыре. По преданию, он тяжело заболел и умер, и братия уже приготовила его к погребению. Но на третий день, перед самыми похоронами, он неожиданно ожил и обратился к инокам с духовным назиданием. После этого чуда Афанасий затворился в пещере на двенадцать лет. Он не видел солнечного света, день и ночь плакал о своих грехах, питался лишь хлебом и водой. Всё это время он не произнёс ни слова, и только перед самой кончиной призвал братию и снова, как в день своего воскресения, призвал их к послушанию, покаянию и молитве, добавив: «Блажен, кто здесь сподобится положенным быть». Память святого церковь отмечает 10 сентября.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная: суффикс -ин указывает на принадлежность. Фамилия Фунина отвечает на вопрос «чей?» и буквально означает «дочь (или жена) Фуни». Мужской вариант — Фунин — получал сын или внук человека по прозвищу Фуня. Такая модель типична для русских фамилий, которые складывались в XV–XVII веках в крестьянской и посадской среде.

Скорее всего, основатель рода Фуниных был человеком из простого сословия. Полные имена в той среде использовали редко — в ходу были уменьшительные и обиходные формы, которые со временем закреплялись за потомками. Имя Фуня встречалось не только само по себе: от него пошли и другие однокоренные фамилии, например Фунин или Фунтиков, что показывает, насколько живой и распространённой была эта форма в народной речи.

Так что фамилия Фунина — это не просто набор звуков, а уменьшительная форма древнего имени с глубоким христианским подтекстом, прошедшая путь от церковного календаря до повседневного прозвища и закрепившаяся в роду.