Фамилия Габайдулиа — редкий случай, когда окончание выдает не русскую, а грузинскую модель фамилии. Суффикс -иа (или -иа) характерен для западной Грузии, особенно для регионов Самегрело и Гурия. В русском языке такие фамилии часто склоняются с трудом, но по происхождению они однозначно указывают на кавказские корни носителя.

Основа фамилии — Габайдул — это адаптированная на грузинской почве форма арабского имени Габдулла (или Абдулла), что означает «раб Божий» или «слуга Аллаха». В исламской традиции это имя широко распространено, а на Кавказе оно попало через тюркские и персидские языки. Примечательно, что в грузинском языке имя, начавшееся с «Г», — не редкость: звук «г» мог добавиться для удобства произношения, либо это результат влияния тюркских диалектов, где «Абдулла» иногда звучало как «Габдулла».

Таким образом, фамилия Габайдулиа — это грузинская версия фамилии, образованной от мусульманского имени. Носитель фамилии мог быть потомком грузина-мусульманина (например, из аджарцев или лазы) или грузина, принявшего ислам в определенный исторический период. Встречаемость фамилии в основном ограничена Грузией и грузинской диаспорой, а в России она крайне редка.