Фамилия Гагриян — редкий случай, когда армянское происхождение почти не вызывает споров, но конкретное значение основы остаётся туманным. Типичный армянский суффикс -ян (в старой орфографии -янц) указывает на принадлежность к роду: «из рода такого-то» или «потомок такого-то». Без этого суффикса основа «Гагриян» не существует как самостоятельное слово в армянском языке, а значит, фамилия образована от прозвища или топонима.

Самая вероятная версия ведёт к армянскому имени или прозвищу Гагр, которое могло быть вариантом имени Гагик (арм. «гагик» — «небесный», «священный», от «гаг» — «небо» или «вершина»). В диалектах восточной Армении имя Гагик иногда сокращалось до Гагр, а суффикс -ян добавлял родовой оттенок. Менее распространённая гипотеза связывает фамилию с географическим названием: в Армении есть село Гагр (ныне в Грузии, в исторической области Джавахетия), и выходцы оттуда могли получить фамилию по месту жительства — Гагриян, то есть «прибывший из Гагр».

В русском контексте фамилия встречается в основном у армян, переселившихся в Россию в XIX–XX веках. Её написание устойчиво — с двумя «р» и окончанием -ян, без вариантов вроде Гагрян или Гагрин, что указывает на фиксацию в документах уже в советское время. Сословной привязки нет: Гагрияны могли быть как крестьянами из Джавахетии, так и городскими ремесленниками. Спектр однокоренных фамилий — Гагинян, Гагиян, Гагрин — редок, и Гагриян среди них выделяется своей фонетической компактностью: короткая основа, ясный суффикс, без лишних наращений.