Фамилия Галиганов — один из тех случаев, когда звучание подсказывает версию, а письменные источники заставляют её перепроверять. На первый взгляд, в основе лежит тюркское слово «гали» (от арабского «али» — высокий, возвышенный) или имя Гали, широко распространённое у татар и башкир. Однако суффикс «-ганов» здесь нестандартный: в русских фамилиях от тюркских основ чаще встречается простое «-ов» (Галимов, Галиев). Форма на «-ганов» наводит на мысль, что перед нами не прямое заимствование, а более сложная словообразовательная цепочка.

Наиболее вероятное объяснение — фамилия происходит от прозвища Галиган, которое могло возникнуть в русской или украинской среде, контактировавшей с тюркскими народами. В диалектах русского юга и Поволжья «галиганом» называли бойкого, пронырливого человека, а иногда — того, кто «галдит», шумит. Это слово — родственное «галдеть» и «гал», то есть шум, крик. Прозвище давали непоседе, задире или, наоборот, горластому торговцу. Суффикс «-ан» в прозвищах (ср. Гулян, Кричан) придавал оттенок действия или свойства: Галиган — тот, кто галит (кричит, балагурит). А фамилия Галиганов — уже «сын или потомок Галигана».

Версия о тюркском происхождении через имя Гали тоже имеет право на жизнь, но с оговоркой. Если бы фамилия образовалась напрямую от имени Гали, мы бы ждали форму Галиганов только в случае, если исходное имя звучало как Галиган (например, уменьшительная форма с тюркским аффиксом «-ган», обозначающим деятеля). Встречаются фамилии Галиганов среди крещёных татар и мишарей, что подтверждает смешанный сценарий: тюркское имя или прозвище, переоформленное по русской модели с суффиксом «-ов» через промежуточную форму на «-ан».

Географически фамилия редкая, но её носители компактно живут в Ульяновской, Самарской областях и в Башкортостане — как раз в зоне исторического контакта славянского и тюркского населения. Так что предки Галигановых могли быть и крестьянами-переселенцами, и казаками, и мещанами, получившими прозвище за характер или занятие. Однозначного ответа, от какого именно слова пошла фамилия, нет, но оба пути — через прозвище Галиган (крикун, задира) или через тюркское имя Гали с местным суффиксом — ведут к человеку заметному, не тихому.