Фамилия Ганюшкин — классический пример русской фамилии, образованной от крестильного имени. В её основе лежит неканоническая, народная форма имени Гавриил — Ганюшка. Имя Гавриил пришло на Русь с христианством из древнееврейского языка, где «Габриэль» означает «моя мощь — Бог» или «крепость Божия». В церковной традиции это имя одного из семи архангелов, того самого, кто возвестил Деве Марии о рождении Христа и истолковал сон пророка Даниила.

Разберёмся с цепочкой превращений. Полное имя Гавриил в быту сокращали до короткого Ганя (по той же модели, что Гаврила — Ганя). От Гани уже образовали уменьшительно-ласкательную форму Ганюшка. Именно она и легла в основу фамилии с помощью патронимического суффикса -ин, который указывал на принадлежность: «чей сын?» — «Ганюшкин», то есть сын Ганюшки.

Эта модель типична для русского ономастикона второй половины XVII — XVIII веков, когда фамилии активно закреплялись за крестьянством и мещанством. Фамилия Ганюшкин фиксируется преимущественно в центральных и северных губерниях России, что подтверждается данными переписей XIX века. Встречается и вариант Ганюшкины — форма множественного числа, традиционно использовавшаяся в документах для обозначения целой семьи или рода («дом Ганюшкиных»).

Интересно, что фамилия сохранила архаичный суффикс -юшк-, который в современном русском языке почти не встречается в словообразовании фамилий. Он придаёт основе ласкательный оттенок, что характерно для домашних, внутрисемейных прозвищ. Таким образом, родоначальник Ганюшкиных был человеком, которого в кругу близких называли ласково — Ганюшка, а его дети и внуки пошли уже по фамилии, закрепившей это тёплое обращение в официальном родовом имени.