Фамилия Ганюшкина образована от уменьшительной формы имени Ганя – Ганюшка, которое, в свою очередь, является вариантом имени Гавриил. Гавриил ведет свое начало от древнееврейского имени Габриел, означающего «моя мощь – Бог» или «крепость Божия». Гавриилом звали одного из семи архангелов. Ему отводится значительное место в еврейских талмудах, поскольку именно он истолковал сон пророка Даниила, благовествовавший Пресвятой Деве Марии рождение Христа, а Захарии - появление на свет Иоанна. Скорее всего, основатель рода Ганюшкиных был выходцем из рабочей или крестьянской среды. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ганюшка, со временем получил фамилию Ганюшкина.